В зависимости от того, на какой оси у тебя время. Я подозреваю, что на X.
При создании графика, в конструктор ты передаешь JSON с параметрами (по-моеум последний параметр). Дак вот, добавь туда коллбэк, для формирования ярлычков для осей.
axes: {
x: {
axisLabelFormatter: labelFormatter,
},
y: {
}
}
labelFormatter - это колбэк, который принимает на вход значения по оси X в местах, в которых dygraph хочет нарисовать метки. Далее, останется только поиграть с шагом сетки, наверняка есть какая-то настройка для этого. Либо просто попробовать вернуть null или undefined из labelFormatter, если ты не хочешь рисовать в данном месте метку.