Создаю модальное окно на Bootstrap. Вставляю в него элементы position: absolute. Как сделать так, чтобы окно автоматически меняло размер?
Почитайте про позиционирование элементов на странице. То, что вы хотите сделать, на чистом css сдать нельзя, но можно попробовать запилить на jquery:
var el_width = $(element).width();
$('#popup').css('width', el_width);
Но не стоит забывать, что пока элемент невиден (display: none, что чаще всего бывает с попапами) его ширина равна нулю, а соответсвенно смысла что-то куда-то подставлять нет.
Единственное, что приходит в голову - это производить все расчеты после инициализации попапа.