В общем решил проблему.
Это код в файле *.tpl
{foreach from = $getAllPerm item = perm}
<div class='group-form'>
{if $userPerm->getUserPerm($perm.perm_key)}
<div class='col-lg-6'><span class='name-form'>{$perm.perm_name}</span></div>
<div class='col-lg-6 text-form' ><input type='text' name='link_name' value='Разрешено'></div>
{else}
<div class='col-lg-6'><span class='name-form'>{$perm.perm_name}</span></div>
<div class='col-lg-6 text-form' ><input type='text' name='link_name' value='Запрещено'></div>
{/if}
</div>
{/foreach}
В файле обработчике (*.php), делаем следующее:
$getAllPerm = $userPerm->getAllPerm($DBQuery);
$smarty->assign('getAllPerm', $getAllPerm);
$smarty->assign('userPerm', $userPerm);